Yayasan An Najiyah Al-Islamiyah mempunyai Visi “Membentuk generasi Islami berkualitas yang memiliki pemahaman islam yang benar berdasarkan Al-Qur’an dan As-Sunnah dan memiliki kemampuan yang unggul dibidang sains dan teknologi” . Untuk mewujudkan visinya ini, Yayasan mempunyai misi-misi sebagai berikut :

1. Merancang sekolah unggulan yang Islami untuk anak yatim, anak dari keluarga miskin dan umum.
2. Mencetak kader da’i yang mempunyai kemampuan Lifeskill.
3. Menjadi lembaga Islam yang profesional
4. Mengembangkan ketrampilan perfikir kritis, sistematis dan analitis
5. Menumbuhkan jiwa kepemimpinan yang tangguh, jujur dan amanah sebagai wujud tanggung jawab seorang muslim yang menguasai sains dan teknologi